2012年12月12日，广州市委市政府在增城召开2010—2012年度广州市共建文明口岸活动总结表彰大会，大会对5个文明口岸及一批先进单位及个人予以表彰，其中广州番禺莲花山港客运口岸荣获“2010-2012年度文明口岸”称号。

　　莲花山客运港口岸每年出入境的旅客超过38万人次，特别是莲花山港客运口岸作为能提供“广州2010亚、残运会”口岸抵离交通服务保障工作的场所之一，以及与南沙港客运口岸实施航班挂港经营合作后，各界人士从广州番禺莲花山港和南沙港往返香港日趋增多，客流量不断增加。从2010年至2012年11月份安全优质运送旅客160.5万人次，创历史新高。目前每日往返莲花山港和南沙港至香港航班达10个航班，节假日增多至13个航班，不仅方便了广大旅客出入境，而且给番禺四百多家经商人士开展外贸提供了便利。

　　由于为推动番禺经济发展起了积极的作用，屡获嘉奖与殊荣：2011年被评为“广州亚运口岸共建活动先进单位”；2012年获授全国首批“世界卫生组织口岸核心能力达标单位”。